Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms