Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms