Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR2F1P10589 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms