Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD4P09016 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms