Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms