Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCTN3O75935 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCTN3O75935 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms