Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIN3BO60391 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms