Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms