Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3AO14802 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3AO14802 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms