Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms