Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HACD1B0YJ81 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms