Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF3BA8MYP8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3BA8MYP8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3BA8MYP8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3BA8MYP8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3BA8MYP8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3BA8MYP8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3BA8MYP8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3BA8MYP8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3BA8MYP8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF3BA8MYP8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms