Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMX3A6NHT5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX3A6NHT5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms