Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VWA3AA6NCI4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VWA3AA6NCI4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VWA3AA6NCI4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VWA3AA6NCI4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VWA3AA6NCI4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VWA3AA6NCI4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VWA3AA6NCI4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWA3AA6NCI4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms