Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms