Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms