Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms