Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXND1Q9Y4D7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXND1Q9Y4D7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms