Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms