Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms