Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF5Q9Y2D1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms