Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNQ9UQP3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms