Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms