Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF8Q9UPP1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms