Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms