Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHIC2Q9UKJ5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms