Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms