Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4Q9UBX2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms