Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHRF1Q9P1Y6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms