Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms