Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms