Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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FAM53CQ9NYF3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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FAM53CQ9NYF3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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FAM53CQ9NYF3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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