Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDREJQ9NTG1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms