Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREX1Q9NSU2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms