Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms