Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms