Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MIXL1Q9H2W2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MIXL1Q9H2W2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms