Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms