Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM54Q9BYV2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms