Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
YTHDF1Q9BYJ9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YTHDF1Q9BYJ9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms