Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms