Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms