Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FYCO1Q9BQS8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms