Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
DUSP9Q99956 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms