Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms