Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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