Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMTK3Q96Q04 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms