Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF3Q96PU9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms