Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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