Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms